全黑豆/局部黑豆:

　　本来应该呈现淡淡青绿色的生豆变成黑色。 　　不成熟的豆子在精制的过程中过度发酵，导致微生物感染，味道混杂，酸臭味、霉味、药物味(酚味phenoic)等等，可能含有生物毒素。　　酸豆/局部酸豆:

　　生豆呈现黄色、黄褐色或红褐色外观，通常伴随发黑的胚芽，采收或后处理时微生物入侵感染，发生污染性发酵，只要有一粒就有刺激性酸味和恶心的味道。 　　霉菌破坏豆: 　　生豆呈现黄色、黄褐色或红褐色斑点，有时斑点上有粉状物，储存不良是主因，如散发孢子会感染其他豆子。 　　味道混杂，发酵味、霉味、土味、酚味等……可能含有生物毒素。 　　虫蛀豆:

　　生豆有虫蛀的孔洞，超过3个孔就列入严重虫蛀。主要是受到Hypothenemushampei(咖啡螟虫)的侵入激腐臭味、浊味、霉味、刺激性酸味等，影响熟豆外观可能含有生物毒素。　　未成熟豆：

　　包裹着黄绿苍白的银皮且不易剥离，生豆内弯。因为不成熟，豆子里的成份不足而且生涩居多，有稻杆味或草青味，会严重破坏口感。影响熟豆外观 　　萎凋豆：

　　生豆外观如缩水般皱褶。起因于营养不良，因此造就不出好咖啡的滋味，呈现干草味影响熟豆外观浮豆。呈现苍白外观，放入水中会浮起来。加工时过度干燥造成。 　　有时有发酵味、霉味、土味等味道或异味不强烈，但是会影响咖啡的滋味。 　　带壳豆： 　　脱壳处理时不当，咖啡豆外层的羊皮层(parchment)未脱去，通常可被筛捡出来。 　　贝壳豆：

　　状似贝壳，因为遗传基因的变异造成。形体单薄，烘焙时较易碳化产生焦味。过多炭化的成份会对健康产生不良的影响。　　破烈豆：

　　精制过程损伤，如脱壳、水洗等，有时破损边会变成黑色。 　　有发酵味、霉味、土味等味道，烘焙时也较易碳化产生焦味。影响熟豆外观，过多碳化的成份会对健康产生不良的影响。 　　其它异物 　　非咖啡的杂质，包括树枝，石块，铜板等。产生各种异味。 　　比较可惜的是，基于成本的考量，并非所有的咖啡业者会认真地筛除瑕疵豆，而只是利用加工的技巧和贩卖的手法使它们不见于世，试想即使在现煮咖啡店里，店家曾经把要煮给你喝的咖啡豆让你看仔细了再煮吗？其实为了确保C/P我们都应该做这样的要求。

　　又如果你是自己在家冲煮咖啡，也一定要挑选出可能存在的瑕疵豆之后再享用。